April 12, 2011 16:59

Pairs : starred

No pairs starred.

Singles : starred

No singles starred.

Selection


Selected pair list (top 100 sorted by syn)

Syn
I
P-value
FDR
Snp 1
Chr 1
Snp 2
Chr 2
I 1
I 2
Samples
Model
0.1774
0.2043
<0.0001
<0.0001
1p532
19p264
0.0030
0.0239
230
M239
0.1753
0.1886
<0.0001
<0.0001
4p389
15p318
0.0024
0.0109
230
M238
0.1720
0.2195
<0.0001
<0.0001
8p91
5p162
0.0068
0.0408
230
M119
0.1720
0.2195
<0.0001
<0.0001
8p91
5p162
0.0068
0.0408
230
M119
0.1511
0.1677
<0.0001
<0.0001
21q364
11q574
0.0062
0.0104
230
M221
0.1361
0.1893
<0.0001
<0.0001
17p732
3p951
0.0158
0.0374
230
M94
0.1353
0.1466
<0.0001
<0.0001
8q343
9q152
0.0089
0.0024
230
M239
0.1347
0.1718
<0.0001
<0.0001
23q306
21q345
0.0147
0.0224
230
M221
0.1324
0.1546
<0.0001
<0.0001
1p532
6p330
0.0030
0.0192
230
M119
0.1324
0.1546
<0.0001
<0.0001
1p532
6p330
0.0030
0.0192
230
M119
0.1321
0.1713
<0.0001
<0.0001
23q306
21q345
0.0168
0.0224
230
M221
0.1313
0.1372
<0.0001
<0.0001
6p330
0.0037
0.0022
230
M119
0.1269
0.1893
<0.0001
<0.0001
10q586
6p330
0.0019
0.0606
230
M119
0.1263
0.1514
<0.0001
<0.0001
8p581
7q665
0.0111
0.0140
230
M87
0.1259
0.1775
<0.0001
<0.0001
19p264
5p162
0.0109
0.0408
230
M239
0.1259
0.1775
<0.0001
<0.0001
19p264
5p162
0.0109
0.0408
230
M239
0.1258
0.1308
<0.0001
<0.0001
17p53
13q780
0.0012
0.0038
230
M119
0.1241
0.1623
<0.0001
<0.0001
5p162
23q300
0.0370
0.0011
230
M94
0.1237
0.1289
<0.0001
<0.0001
8q343
0.0037
0.0016
230
M239
0.1221
0.1609
<0.0001
<0.0001
7p345
2q932
0.0031
0.0357
230
M87
0.1212
0.1410
<0.0001
<0.0001
8p581
0.0111
0.0087
230
M238
0.1201
0.1421
<0.0001
<0.0001
7p744
11q910
0.0212
0.0009
230
M87
0.1193
0.2123
<0.0001
<0.0001
3p951
9p581
0.0312
0.0618
230
M94
0.1188
0.1468
<0.0001
<0.0001
19p264
5p162
0.0239
0.0041
230
M127
0.1188
0.1609
<0.0001
<0.0001
23q306
21q345
0.0147
0.0274
230
M221
0.1186
0.1426
<0.0001
<0.0001
21q345
19q167
0.0045
0.0195
230
M78
0.1179
0.1451
<0.0001
<0.0001
8p581
0.0170
0.0102
230
M95
0.1177
0.1521
<0.0001
<0.0001
23q306
21q345
0.0147
0.0196
230
M220
0.1173
0.1323
<0.0001
<0.0001
15p318
5p162
0.0109
0.0041
230
M119
0.1170
0.1515
<0.0001
<0.0001
21q345
10p398
0.0274
0.0070
230
M231
0.1169
0.1611
<0.0001
<0.0001
23q306
21q345
0.0168
0.0274
230
M221
0.1144
0.1381
<0.0001
<0.0001
7p345
13p318
0.0031
0.0206
230
M221
0.1139
0.1469
<0.0001
<0.0001
19p264
5p162
0.0239
0.0091
230
M127
0.1126
0.1490
<0.0001
<0.0001
23q306
21q345
0.0168
0.0196
230
M220
0.1119
0.1434
<0.0001
<0.0001
19p730
2p683
0.0067
0.0249
230
M85
0.1117
0.1361
<0.0001
<0.0001
1p532
6p330
0.0052
0.0192
230
M231
0.1117
0.1361
<0.0001
<0.0001
1p532
6p330
0.0052
0.0192
230
M231
0.1115
0.1270
<0.0001
<0.0001
2q123
0.0044
0.0111
230
M239
0.1111
0.1222
<0.0001
<0.0001
17p53
13q780
0.0012
0.0100
230
M239
0.1108
0.1369
<0.0001
<0.0001
0.0111
0.0150
230
M239
0.1104
0.1570
<0.0001
<0.0001
2p907
0.0272
0.0194
230
M223
0.1102
0.1486
<0.0001
<0.0001
3p951
21q344
0.0160
0.0224
230
M239
0.1096
0.1347
<0.0001
<0.0001
19p731
1p450
0.0249
0.0002
230
M229
0.1095
0.1451
<0.0001
<0.0001
1p532
19p264
0.0117
0.0239
230
M239
0.1086
0.1406
<0.0001
<0.0001
2p907
0.0024
0.0296
230
M91
0.1086
0.1348
<0.0001
<0.0001
6p330
11p449
0.0103
0.0159
230
M221
0.1084
0.1420
<0.0001
<0.0001
4q837
12p247
0.0208
0.0128
230
M238
0.1084
0.1420
<0.0001
<0.0001
4q837
12p247
0.0208
0.0128
230
M238
0.1083
0.1145
<0.0001
<0.0001
10q586
2q123
0.0019
0.0044
230
M94
0.1082
0.1170
<0.0001
<0.0001
2q15
0.0051
0.0037
230
M239
0.1079
0.1234
<0.0001
<0.0001
8p923
4p389
0.0002
0.0153
230
M238
0.1067
0.1653
<0.0001
<0.0001
12p247
23q300
0.0522
0.0064
230
M127
0.1067
0.1653
<0.0001
<0.0001
12p247
23q300
0.0522
0.0064
230
M127
0.1067
0.1653
<0.0001
<0.0001
23q300
12p247
0.0064
0.0522
230
M223
0.1067
0.1653
<0.0001
<0.0001
12p247
23q300
0.0522
0.0064
230
M127
0.1067
0.1653
<0.0001
<0.0001
23q300
0.0522
0.0064
230
M127
0.1067
0.1653
<0.0001
<0.0001
23q300
0.0522
0.0064
230
M127
0.1067
0.1653
<0.0001
<0.0001
23q300
0.0522
0.0064
230
M127
0.1067
0.1653
<0.0001
<0.0001
23q300
0.0522
0.0064
230
M127
0.1067
0.1653
<0.0001
<0.0001
12p247
23q300
0.0522
0.0064
230
M127
0.1067
0.1653
<0.0001
<0.0001
12p247
23q300
0.0522
0.0064
230
M127
0.1067
0.1436
<0.0001
<0.0001
6p330
19p264
0.0130
0.0239
230
M239
0.1066
0.1126
<0.0001
<0.0001
14p318
1p450
0.0027
0.0034
230
M229
0.1065
0.1265
<0.0001
<0.0001
15p318
5p162
0.0109
0.0091
230
M119
0.1064
0.1269
<0.0001
<0.0001
20q269
20p444
0.0020
0.0185
230
M238
0.1064
0.1306
<0.0001
<0.0001
6p330
21q364
0.0181
0.0062
230
M95
0.1062
0.1346
<0.0001
<0.0001
7p942
5p162
0.0096
0.0188
230
M238
0.1059
0.1202
<0.0001
<0.0001
7q944
3p951
0.0060
0.0083
230
M239
0.1059
0.1118
<0.0001
<0.0001
17q933
8q343
0.0043
0.0016
230
M221
0.1057
0.1491
<0.0001
<0.0001
10q459
3p951
0.0060
0.0374
230
M238
0.1056
0.1315
<0.0001
<0.0001
0.0024
0.0234
230
M95
0.1055
0.1254
<0.0001
<0.0001
9p411
20p444
0.0014
0.0185
230
M220
0.1054
0.1466
<0.0001
<0.0001
16p184
16q290
0.0050
0.0362
230
M229
0.1054
0.1466
<0.0001
<0.0001
16p184
16q290
0.0050
0.0362
230
M229
0.1053
0.1126
<0.0001
<0.0001
3p951
23q300
0.0061
0.0011
230
M127
0.1053
0.1190
<0.0001
<0.0001
8p923
19q1026
0.0022
0.0115
230
M239
0.1052
0.1482
<0.0001
<0.0001
2q15
7q773
0.0051
0.0379
230
M95
0.1052
0.1213
<0.0001
<0.0001
8p91
8q343
0.0096
0.0065
230
M15
0.1051
0.1257
<0.0001
<0.0001
17p53
0.0206
2.5504e-5
230
M238
0.1041
0.1185
<0.0001
<0.0001
1p239
16q431
0.0006
0.0138
230
M223
0.1039
0.1143
<0.0001
<0.0001
3p951
2q15
0.0053
0.0051
230
M79
0.1039
0.1333
<0.0001
<0.0001
21q345
10p398
0.0224
0.0070
230
M231
0.1032
0.1261
<0.0001
<0.0001
11q571
5p162
0.0011
0.0219
230
M94
0.1032
0.1261
<0.0001
<0.0001
11q571
5p162
0.0011
0.0219
230
M94
0.1030
0.1368
<0.0001
<0.0001
4q837
12p247
0.0208
0.0129
230
M238
0.1029
0.1420
<0.0001
<0.0001
18q634
2p683
0.0142
0.0249
230
M95
0.1027
0.1517
<0.0001
<0.0001
2p907
0.0296
0.0194
230
M95
0.1026
0.1269
<0.0001
<0.0001
7p345
7p744
0.0031
0.0212
230
M239
0.1026
0.1375
<0.0001
<0.0001
21q345
2q734
0.0196
0.0152
230
M239
0.1023
0.1032
<0.0001
<0.0001
13p318
0.0008
2.5504e-5
230
M238
0.1023
0.1032
<0.0001
<0.0001
13p318
0.0008
2.5504e-5
230
M238
0.1023
0.1557
<0.0001
<0.0001
8p944
3p951
0.0212
0.0323
230
M94
0.1021
0.1287
<0.0001
<0.0001
4q300
0.0072
0.0194
230
M231
0.1019
0.1051
<0.0001
<0.0001
8p91
11q910
0.0023
0.0009
230
M239
0.1019
0.1152
<0.0001
<0.0001
15p318
16p184
0.0109
0.0024
230
M127
0.1012
0.1423
<0.0001
<0.0001
3p951
0.0037
0.0374
230
M95
0.1012
0.1660
<0.0001
<0.0001
1p532
3p951
0.0399
0.0248
230
M29
0.1012
0.1244
<0.0001
<0.0001
21q345
7p288
0.0224
0.0009
230
M93
0.1011
0.1267
<0.0001
<0.0001
8p944
9q607
0.0212
0.0045
230
M119
0.1008
0.1389
<0.0001
<0.0001
14p318
2q932
0.0023
0.0357
230
M223

Interaction Network


Gene ontology (biological process, p-value threshold: 0.05)

#snp
p-value
fold-en
genes
GO:name
3
0.0400
4.21
mammary gland epithelium development (GO:0061180)
2
0.0300
8.41
oocyte differentiation (GO:0009994)
2
0.0300
8.41
    oocyte development (GO:0048599)
2
0.0100
12.62
        oocyte maturation (GO:0001556)
3
0.0400
4.21
response to mechanical stimulus (GO:0009612)
2
0.0300
8.41
signal complex assembly (GO:0007172)
2
0.0400
6.31
embryonic placenta development (GO:0001892)
5
0.0200
3.15
cell division (GO:0051301)
2
0.0300
8.41
    cytokinesis (GO:0000910)
2
0.0100
12.62
        regulation of cytokinesis (GO:0032465)