April 12, 2011 16:57

Pairs : starred

No pairs starred.

Singles : starred

No singles starred.

Selection


Selected pair list (top 100 sorted by syn)

Syn
I
P-value
FDR
Snp 1
Chr 1
Snp 2
Chr 2
I 1
I 2
Samples
Model
0.1753
0.1935
<0.0001
<0.0001
15q341
1p651
0.0030
0.0152
208
M239
0.1637
0.1857
<0.0001
<0.0001
1p730
16q667
0.0201
0.0019
208
M94
0.1572
0.1861
<0.0001
<0.0001
2p190
14p318
0.0059
0.0230
208
M238
0.1572
0.1861
<0.0001
<0.0001
2p190
14p318
0.0059
0.0230
208
M238
0.1484
0.2039
<0.0001
<0.0001
6p330
11p240
0.0126
0.0428
208
M78
0.1480
0.1512
<0.0001
<0.0001
15q341
6p330
0.0030
0.0002
208
M94
0.1476
0.1674
<0.0001
<0.0001
17p732
19q148
0.0163
0.0035
208
M231
0.1476
0.1674
<0.0001
<0.0001
17p732
19q148
0.0163
0.0035
208
M231
0.1453
0.1743
<0.0001
<0.0001
18q290
0.0139
0.0151
208
M95
0.1421
0.1541
<0.0001
<0.0001
1p893
13p318
0.0103
0.0017
208
M238
0.1355
0.2010
<0.0001
<0.0001
3p951
15p318
0.0654
4.2324e-5
208
M87
0.1320
0.1538
<0.0001
<0.0001
6p330
5p162
0.0142
0.0076
208
M220
0.1320
0.1538
<0.0001
<0.0001
6p330
5p162
0.0142
0.0076
208
M220
0.1302
0.1447
<0.0001
<0.0001
1p893
22p318
0.0103
0.0041
208
M238
0.1295
0.1517
<0.0001
<0.0001
15q341
1p651
0.0069
0.0152
208
M239
0.1265
0.1695
<0.0001
<0.0001
5p162
4q661
0.0199
0.0231
208
M78
0.1263
0.1424
<0.0001
<0.0001
1p893
22p318
0.0103
0.0058
208
M238
0.1259
0.1491
<0.0001
<0.0001
7p914
6p330
0.0179
0.0053
208
M223
0.1244
0.1486
<0.0001
<0.0001
17p731
10q571
0.0231
0.0012
208
M221
0.1233
0.1436
<0.0001
<0.0001
1p730
19p731
0.0201
0.0002
208
M229
0.1231
0.1736
<0.0001
<0.0001
6p330
0.0109
0.0397
208
M238
0.1210
0.2206
<0.0001
<0.0001
17p53
3p951
0.0342
0.0654
208
M221
0.1209
0.1273
<0.0001
<0.0001
14p318
9q198
0.0052
0.0011
208
M86
0.1199
0.1979
<0.0001
<0.0001
2q938
1q726
0.0225
0.0555
208
M221
0.1199
0.1377
<0.0001
<0.0001
7q987
9p581
0.0100
0.0079
208
M94
0.1198
0.1262
<0.0001
<0.0001
5p162
9p48
0.0007
0.0057
208
M221
0.1196
0.2158
<0.0001
<0.0001
1q726
7p914
0.0555
0.0407
208
M95
0.1196
0.2158
<0.0001
<0.0001
1q726
7p914
0.0555
0.0407
208
M95
0.1187
0.1393
<0.0001
<0.0001
4q300
5p162
0.0200
0.0006
208
M119
0.1186
0.1781
<0.0001
<0.0001
9q198
3p951
0.0044
0.0551
208
M238
0.1184
0.1899
<0.0001
<0.0001
22q249
3p951
0.0163
0.0551
208
M94
0.1182
0.1352
<0.0001
<0.0001
19q974
4p389
0.0146
0.0023
208
M94
0.1178
0.1561
<0.0001
<0.0001
5p162
13q382
0.0351
0.0032
208
M87
0.1178
0.1368
<0.0001
<0.0001
18q447
7q990
0.0121
0.0069
208
M237
0.1178
0.1709
<0.0001
<0.0001
5p162
6p330
0.0408
0.0123
208
M74
0.1171
0.1463
<0.0001
<0.0001
6p330
23q950
0.0063
0.0229
208
M95
0.1171
0.1463
<0.0001
<0.0001
6p330
23q950
0.0063
0.0229
208
M95
0.1170
0.1412
<0.0001
<0.0001
15q450
9q198
0.0230
0.0011
208
M94
0.1170
0.1458
<0.0001
<0.0001
11q346
7q431
0.0043
0.0245
208
M87
0.1170
0.1561
<0.0001
<0.0001
19q1027
6p330
0.0292
0.0099
208
M95
0.1170
0.1561
<0.0001
<0.0001
19q1027
6p330
0.0292
0.0099
208
M95
0.1163
0.1234
<0.0001
<0.0001
15q341
6p330
0.0069
0.0002
208
M238
0.1155
0.1507
<0.0001
<0.0001
9q120
6p330
0.0290
0.0063
208
M93
0.1155
0.1507
<0.0001
<0.0001
9q120
6p330
0.0290
0.0063
208
M93
0.1151
0.1406
<0.0001
<0.0001
7p914
5p162
0.0179
0.0076
208
M94
0.1150
0.1610
<0.0001
<0.0001
1q727
23q430
0.0082
0.0378
208
M95
0.1147
0.1596
<0.0001
<0.0001
8p91
7p914
0.0042
0.0407
208
M221
0.1147
0.1596
<0.0001
<0.0001
8p91
7p914
0.0042
0.0407
208
M221
0.1146
0.1505
<0.0001
<0.0001
19q1027
18p947
0.0292
0.0067
208
M15
0.1146
0.1505
<0.0001
<0.0001
19q1027
18p947
0.0292
0.0067
208
M15
0.1145
0.1416
<0.0001
<0.0001
11q346
7q431
0.0026
0.0245
208
M87
0.1141
0.1378
<0.0001
<0.0001
9q198
2q938
0.0011
0.0225
208
M94
0.1140
0.1215
<0.0001
<0.0001
11q574
7q990
0.0044
0.0031
208
M239
0.1139
0.1286
<0.0001
<0.0001
10q581
2q19
0.0129
0.0018
208
M94
0.1136
0.1893
<0.0001
<0.0001
7q431
3p149
0.0245
0.0512
208
M87
0.1134
0.1654
<0.0001
<0.0001
9q940
14p318
0.0072
0.0448
208
M221
0.1131
0.1794
<0.0001
<0.0001
2q650
14p318
0.0077
0.0587
208
M29
0.1131
0.1794
<0.0001
<0.0001
2q650
14p318
0.0077
0.0587
208
M29
0.1130
0.1572
<0.0001
<0.0001
5q456
0.0046
0.0397
208
M255
0.1128
0.1209
<0.0001
<0.0001
3p951
6p330
0.0017
0.0063
208
M220
0.1124
0.1253
<0.0001
<0.0001
5p162
6p330
0.0076
0.0053
208
M93
0.1123
0.1366
<0.0001
<0.0001
2q938
3p951
0.0225
0.0017
208
M127
0.1122
0.1511
<0.0001
<0.0001
7q431
1p651
0.0245
0.0144
208
M95
0.1121
0.1420
<0.0001
<0.0001
13q382
5p162
0.0032
0.0268
208
M93
0.1119
0.1227
<0.0001
<0.0001
7q944
6p330
0.0057
0.0052
208
M94
0.1116
0.1780
<0.0001
<0.0001
3p149
1p651
0.0512
0.0152
208
M15
0.1112
0.1608
<0.0001
<0.0001
11p244
12p247
0.0196
0.0300
208
M94
0.1111
0.1191
<0.0001
<0.0001
3p951
6p330
0.0017
0.0063
208
M92
0.1111
0.1191
<0.0001
<0.0001
3p951
6p330
0.0017
0.0063
208
M92
0.1111
0.1304
<0.0001
<0.0001
1p893
6p330
0.0147
0.0047
208
M94
0.1111
0.1866
<0.0001
<0.0001
11p772
3p951
0.0430
0.0326
208
M231
0.1110
0.1491
<0.0001
<0.0001
18q634
6p330
0.0187
0.0194
208
M94
0.1106
0.1350
<0.0001
<0.0001
3p951
5p162
0.0168
0.0076
208
M231
0.1104
0.1411
<0.0001
<0.0001
1p730
15q754
0.0201
0.0105
208
M239
0.1104
0.1458
<0.0001
<0.0001
9p581
5p162
0.0320
0.0034
208
M87
0.1103
0.1188
<0.0001
<0.0001
6p330
22q289
0.0059
0.0026
208
M238
0.1102
0.1376
<0.0001
<0.0001
18q634
14p318
0.0044
0.0230
208
M93
0.1102
0.1376
<0.0001
<0.0001
18q634
14p318
0.0044
0.0230
208
M93
0.1100
0.1819
<0.0001
<0.0001
17p53
3p951
0.0168
0.0551
208
M86
0.1098
0.1152
<0.0001
<0.0001
6p330
2q938
0.0053
0.0002
208
M31
0.1097
0.1599
<0.0001
<0.0001
21q802
0.0458
0.0044
208
M119
0.1092
0.1469
<0.0001
<0.0001
19q974
14p318
0.0146
0.0230
208
M79
0.1090
0.1224
<0.0001
<0.0001
7q987
5p162
0.0100
0.0034
208
M94
0.1087
0.1368
<0.0001
<0.0001
22q730
6p330
0.0182
0.0099
208
M93
0.1086
0.1321
<0.0001
<0.0001
6p330
0.0042
0.0194
208
M238
0.1081
0.1409
<0.0001
<0.0001
3p951
19p731
0.0326
0.0002
208
M31
0.1081
0.1660
<0.0001
<0.0001
1p730
23q430
0.0201
0.0378
208
M94
0.1078
0.1515
<0.0001
<0.0001
19q1027
7q691
0.0292
0.0145
208
M229
0.1078
0.1515
<0.0001
<0.0001
19q1027
7q691
0.0292
0.0145
208
M229
0.1076
0.1500
<0.0001
<0.0001
6p330
0.0028
0.0397
208
M238
0.1075
0.1865
<0.0001
<0.0001
17p53
14p318
0.0342
0.0448
208
M239
0.1073
0.1626
<0.0001
<0.0001
5p162
1p730
0.0351
0.0201
208
M79
0.1073
0.1236
<0.0001
<0.0001
22p318
18q290
0.0041
0.0122
208
M83
0.1073
0.1572
<0.0001
<0.0001
7q945
0.0102
0.0397
208
M239
0.1071
0.1412
<0.0001
<0.0001
11p244
12p247
0.0040
0.0300
208
M221
0.1071
0.1458
<0.0001
<0.0001
19q1027
18p947
0.0292
0.0095
208
M92
0.1071
0.1458
<0.0001
<0.0001
19q1027
18p947
0.0292
0.0095
208
M92
0.1069
0.1412
<0.0001
<0.0001
11p244
12p247
0.0043
0.0300
208
M221
0.1064
0.1391
<0.0001
<0.0001
1p893
23q950
0.0099
0.0229
208
M239
0.1059
0.1146
<0.0001
<0.0001
5q456
8p91
0.0046
0.0042
208
M94

Interaction Network


Gene ontology (biological process, p-value threshold: 0.05)

#snp
p-value
fold-en
genes
GO:name
2
0.0500
5.93
fibrinolysis (GO:0042730)
4
0.0200
9.88
regulation of RNA stability (GO:0043487)
3
0.0200
9.88
neuroprotection (GO:0043526)
8
0.0400
2.40
proteolysis (GO:0006508)
3
0.0500
5.93
regulation of receptor activity (GO:0010469)
4
0.0300
4.44
regulation of cell division (GO:0051302)
4
0.0300
4.94
    positive regulation of cell division (GO:0051781)